关于骷髅蜥蜴的死亡方式，综合不同来源的信息分析如下：

其他作品中的衍生设定

在漫画《意外修仙!与哥斯拉共同守护地球》中，骷髅蜥蜴被描述为拥有四个心房、能在水下潜伏的生物，但该作品与《金刚骷髅岛》无直接关联，其死亡方式属于独立创作。

游戏中的表现

在《意外修仙!与哥斯拉共同守护地球》的游戏中，骷髅蜥蜴的死亡方式与官方设定一致，仍被金刚击杀。

总结：

骷髅蜥蜴的死亡方式主要来源于《金刚骷髅岛》的官方设定，即被金刚以强大力量彻底消灭。其他衍生作品中的表现则属于独立创作，与原版设定无关。