巴哥犬存在血统不纯的现象，主要原因与遗传因素、繁殖实践和社会经济因素相关，具体分析如下：

一、遗传因素与基因缺陷

面部结构遗传限制

巴哥犬的标志性面部特征（如褶皱皮肤、短鼻、平嘴等）由显性基因控制，但基因存在隐性缺陷。纯种犬只易出现皮肤褶皱感染、呼吸道疾病等遗传问题，导致繁殖者倾向于选择外观更标准的个体，进一步加剧了遗传缺陷的传播。

繁殖难度高

该犬种存在难产问题，母犬需通过剖腹产才能分娩，且幼犬出生时面部皮肤未完全发育，需人工护理褶皱皮肤，这限制了自然选择对优良基因的筛选，导致纯种化进程缓慢。

二、繁殖实践因素

市场需求驱动

巴哥犬因可爱的外貌和温顺性格，深受消费者喜爱，市场对其纯种度要求较高。繁殖者为满足市场需求，常选择外观更标准的个体进行繁殖，而忽视了遗传健康。

血统证书的局限性

部分血统证书可能无法准确反映犬只的健康状况或遗传缺陷，导致消费者对证书的信任度降低，间接推动非纯种犬只的流通。

三、社会经济因素

价格差异显著

纯种巴哥犬价格较高（约3000元），而非纯种犬只因外观不佳或健康问题售价较低。这种价格差异导致繁殖者更倾向于繁殖成本较低的非纯种犬只。

非法繁殖渠道

部分非正规繁殖场为降低成本，可能使用近亲繁殖或未绝育的母犬，进一步加剧了遗传问题。