巴哥犬的毛色特征与其遗传基因和生理结构密切相关，具体原因如下：

皮肤褶皱的遗传特征

巴哥犬最显著的特征是其皮肤褶皱，这些褶皱是由皮肤与皮下脂肪层过度折叠形成的。这种皮肤结构为色素细胞提供了更多的附着位点，从而促进了色素的沉积。因此，褶皱越多的地方（如脸部、胸部、腹部等），毛色往往越深。

色素细胞分布差异

不同毛色类型的巴哥犬，其色素细胞在皮肤中的分布密度不同。例如，黑色巴哥犬的色素细胞更为集中，而其他颜色（如淡黄、银色）的色素细胞分布相对稀疏。这种差异导致了毛色的深浅变化。

基因与表型的关联

毛色是犬类遗传基因表达的结果。巴哥犬的特定基因组合使其具有这种独特的皮肤褶皱和色素沉积模式，这是长期进化过程中形成的表型特征。

需要说明的是，毛色深浅并不影响犬只的健康或性格，不同毛色个体均能表现出忠诚、友善等优秀品质。